Identificación de cepas de ratón mediante PCR

Noticias Especialistas Benavides

Fernando BenavidesFernando Benavides es Médico Veterinario de la Universidad de Buenos Aires (1986) y Doctor en Genética de la Universidad de Buenos Aires (1998) (Director de Tesis: J-L Guénet, Institut Pasteur de París). Entre los años 1989-1998 se desempeñó como Director del Bioterio de la Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. En 1998 comenzó una beca postdoctoral en The University of Texas, MD Anderson Cancer Center, Smithville, Texas, Estados Unidos (Laboratorio del Dr. Claudio Conti). En el año 2003 se diplomó en el American College of Laboratory Animal Medicine (ACLAM). Desde el año 2006 se desempeña como Director de los Servicios Genéticos del MD Anderson Cancer Center. Actualmente es Profesor Asociado y miembro veterinario del IACUC en el MD Anderson Cancer Center.

Fernando nos ayudará o guiará en los siguientes temas:

  1. Conceptos básicos de genética de roedores (incluye genoma del ratón y la rata).
  2. Líneas estandarizadas y nomenclatura estándar (rata y ratón).
  3. Roedores genéticamente modificados.
  4. Influencia del fondo genético en los modelos de rata y ratón (incluye speed congenics).
  5. Controles de calidad genética de ratas y ratones.
  6. Modelos de cáncer experimental en ratón.
  7. Clonado de mutaciones espontáneas (forward genetics).

Todas las consultas que tengan deben enviarlas a bioterioscom@gmail.com e iremos agregando las preguntas y respuestas en esta sección.

Consulta:

1-¿Es posible la identificación de cepa mediante PCR?

2-¿Cuál o cuáles son los cebadores para la identificación de la cepa BALB/c y cuál para la cepa CD-1 (ICR)?

Respuesta:

1-Por supuesto, PCR es hoy en día la técnica estándar para identificación de cepas consanguíneas, especialmente con el uso de cebadores que amplifican secuencias de microsatélite de ADN (conocidos con las siglas SSLP o STR).

2-No existe una lista estándar de cebadores para identificar cepas. Los cebadores se deben seleccionar de entre los más de 6.000 microsatellites de ratón (Mus musculus) disponibles, dependiendo de la situación (por ejemplo, qué otras cepas se ecuentran alojadas en el mismo bioterio, etc.). El número de marcadores a utilizar también depende de cada caso, pero para una identificación simple en general se pueden utilizar entre 20 y 40 SSLPs. En el caso de CD-1, como es una colonia exocriada (outbred) es mucho más difícil identificar o comprobar su origen. Te recomiendo que bajes gratuitamente el capítulo IV de nuestro libro, disponible en la página de SECAL: http://secal.es/publicaciones/libros/

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Seguiremos ofreciendo un espacio para todos aquellos que quieran participar y colaborar en esta cruzada educativa, porque tenemos muy claro que estaremos constantemente: “Aprendiendo de los Animales de Laboratorio”.

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