La Gene Expression Database (GXD) utiliza la Mouse Developmental Anatomy Ontology para describir los patrones de expresión de una manera estandarizada. Esta ontología se ha mejorado de manera significativa, y un nuevo navegador sobre anatomía ha sido implementado, el cual es más interactivo y proporciona un acceso más fácil a la información de la anatomía y datos de expresión asociados. 

La nueva versión del Mouse Developmental Anatomy Ontology, desarrollado en colaboración con EMAP, proporciona una "representación abstracta" de la anatomía que especifíca estructuras anatómicas junto con sus rangos de etapas de desarrollo (Theiler). Esta representación abstracta es en adición a las etapas específicas representadas para todos las etapas de Theiler que se encontraban disponibles. Además, la organización jerárquica de la ontología ahora permite que términos anatómicos tengan múltiples padres (es decir, un gráfico acíclico dirigido). Por lo tanto, la anatomía se puede representar y buscar desde múltiples perspectivas.

El nuevo navegador Mouse Developmental Anatomy permite a los usuarios navegar a través de esta ontología para localizar estructuras anatómicas específicas y para obtener datos de expresión asociados. Este navegador contiene tres secciones interactivas: búsqueda, detalle de los términos, y vista de árbol. La búsqueda se facilita con la ayuda de la lista de autocompletar. La vista de árbol permite la visualización de los términos en contexto, proporcionando la capacidad para expandir y contraer las ramas, así  como proporcionar enlaces a los datos de expresión asociados. El detalle de los términos proporciona información sobre cada término, así como le permite a los usuarios alternar entre etapas específicas e instancias de términos independientes de la etapa.

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